Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RorcP51450 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RorcP51450 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RorcP51450 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RorcP51450 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms