Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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