Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms