Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TP20293 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
TP20293 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
TP20293 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TP20293 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TP20293 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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