Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csn1s1P19228 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms