Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18524 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18524 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18524 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18524 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18524 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18524 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18524 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18524 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms