Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms