Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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H2-Eb1P04230 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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H2-Eb1P04230 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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