Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
GzmbP04187 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms