Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20939L7N243 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms