Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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