Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp72F8VQC1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms