Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms