Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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