Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms