Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms