Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Robo3Q9Z2I4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms