Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms