Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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