Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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