Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp29Q9ES63 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms