Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms