Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufs3Q9DCT2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms