Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms