Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms