Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms