Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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