Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc8Q9D2H8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms