Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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