Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms