Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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PtprtQ99M80 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PtprtQ99M80 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PtprtQ99M80 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PtprtQ99M80 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PtprtQ99M80 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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