Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ciao1Q99KN2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ciao1Q99KN2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ciao1Q99KN2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ciao1Q99KN2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms