Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rprd1aQ8VDS4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1aQ8VDS4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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