Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms