Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp47Q8BY87 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms