Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tnfsfm13Q8BXS2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tnfsfm13Q8BXS2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tnfsfm13Q8BXS2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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