Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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