Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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