Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.6 ms