Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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