Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms