Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms