Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms