Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms