Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms