Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms