Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms