Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Pate4Q09098 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms