Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GscQ02591 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GscQ02591 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms