Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms